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熒光標記菌株

 image.png報告基因(Reporter Gene):通常指可編碼某種蛋白或酶,其表達產(chǎn)物容易被檢測,并且能與內源性背景蛋白相區別的基因,通過(guò)它的表達產(chǎn)物來(lái)標定目的基因的表達調控。
 

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熒光素酶報告基因是指以熒光素(luciferin)為底物來(lái)檢測螢火蟲(chóng)熒光素酶(fireflyluciferase)活性的一種報告系統。熒光素酶可以催化luciferin氧化成oxyluciferin,在luciferin氧化的過(guò)程中,會(huì )發(fā)出生物熒光(bioluminescence);
 
一、原理簡(jiǎn)述
(1)構建一個(gè)將靶啟動(dòng)子的特定片段插入到熒光素酶表達序列前方的報告基因質(zhì)粒,如pGL3-basic等。
(2) 將要檢測的轉錄因子表達質(zhì)粒與報告基因質(zhì)粒共轉染293細胞或其它相關(guān)的細胞系。如果此轉錄因子能夠激活靶啟動(dòng)子,則熒光素酶基因就會(huì )表達,熒光素酶的表達量與轉錄因子的作用強度成正比。
(3) 加入特定的熒光素酶底物,熒光素酶與底物反應,產(chǎn)生熒光,通過(guò)檢測熒光的強度可以測定熒光素酶的活性,從而判斷轉錄因子是否能與此靶啟動(dòng)子片段有作用。
 
二、技術(shù)流程
(1) 用生物信息學(xué)方法分析并預測啟動(dòng)子區可能的轉錄因子結合位點(diǎn)。
(2)設計引物用PCR法從基因組DNA中克隆所需的靶啟動(dòng)子片段,將此片段插入到熒光素酶報告基因質(zhì)粒(pGL3-basic)中。
(3)篩選陽(yáng)性克隆,測序。擴增克隆并提純質(zhì)粒備用。
(4) 擴增轉錄因子質(zhì)粒,提純備用。同時(shí)準備相應的空載質(zhì)粒對照,提純備用。
(5) 培養293(或其它目的細胞),并接種于24孔板中,生長(cháng)10-24小時(shí)(80%匯合度)。
(6) 將報告基因質(zhì)粒與轉錄因子表達質(zhì)粒共轉染細胞。
(7)提取蛋白并用于熒光素酶檢測。
(8) 加入底物,測定熒光素酶的活性。
(9) 計算相對熒光強度,并與空載對照比較。
 
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綠色熒光蛋白的發(fā)光原理
GFP的第65至67位的三個(gè)氨基酸(絲氨酸-酪氨酸-甘氨酸)殘基,可自發(fā)地形成一種熒光發(fā)色團。當蛋白質(zhì)鏈折疊時(shí),這段被深埋在蛋白質(zhì)內部的氨基酸片段,得以“親密接觸”,導致經(jīng)環(huán)化形成咪唑酮,并發(fā)生脫水反應。在分子氧存在的條件下,發(fā)色團可進(jìn)一步發(fā)生氧化脫氫,最終成熟,形成可發(fā)射熒光的形式。具體過(guò)程為:在 O2存在下,GFP分子內第67位甘氨酸的酰胺對第65位絲氨酸的羧基進(jìn)行親核攻擊,形成第5位碳原子咪唑基;第66位酪氨酸的α2β鍵脫氫反應之后,導致芳香團與咪唑基結合,并最終自發(fā)催化形成對羥基苯甲酸咪唑環(huán)酮生色。
GFP需要在氧化狀態(tài)下產(chǎn)生熒光,強還原劑能使GFP轉變?yōu)榉菬晒庑问?,但一旦重新暴露在空氣或氧氣中,GFP熒光便立即得到恢復。一般來(lái)說(shuō)弱還原劑并不會(huì )影響GFP熒光,中度氧化劑如生物材料的固定,脫水劑戊二酸或甲醛等對GFP熒光影響也不大。
綠色熒光蛋白的發(fā)光特性
GFP吸收的光譜最大峰值為395nm(紫外),并有一個(gè)峰值為470nm的副吸收峰(藍光);發(fā)射光譜最大峰值為509nm(綠光),并帶有峰值為540nm的側峰(Shouder)。雖然450~490nm只是GFP的副吸收峰,但由于該激發(fā)光對細胞的傷害更小,因此通常多使用該波段光源(多為488nm)。此外,GFP的光譜特性與熒光素異硫氰酸鹽(FITC)很相似,兩者通常共有一套濾光片。GFP熒光極其穩定,在激發(fā)光照射下,GFP抗光漂白(Photobleaching)能力比熒光素強,特別是在450~490nm藍光波長(cháng)下更穩定。類(lèi)似的,GFP融合蛋白的熒光靈敏度遠比熒光素標記的熒光抗體高,抗光漂白能力強,因此更適用于定量測定與分析。由于GFP熒光的產(chǎn)生不需要任何外源反應底物,因此GFP作為一種廣泛應用的活體報告蛋白,其作用是任何其它酶類(lèi)報告蛋白無(wú)法比擬的。但因為GFP不是酶,熒光信號沒(méi)有酶學(xué)放大效果,因此GFP靈敏度可能低于某些酶類(lèi)報告蛋白,比如螢火蟲(chóng)熒光素酶等。
 
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